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微生物除臭剂烃类的降解途径根据同类的化学结构特点，主要可分为两部分：脂肪烃的降解途径和芳香烃的降解途径。无论是脂肪烃降解途径还是芳香烃降解途径，均通过微生物所生成的脱氢酶或是加氧酶以实现对烃类物质降解的快速催化。如能催化正烷烃为正烷烃的氢过氧化物的正烷烃氧化酶。2.4 含氧有机物恶臭气体的去除含氧有机物恶臭气体，如醛类、酚类化合物均易溶于水，而微生物对该类恶臭气体物质的去除原理与烃类恶臭气体物质的去除原理相似，均主要通过微生物生成的相关酶的催化降解作用。能够降解酚类化合物的微生物有Rhizobium（根瘤菌）、Fusarium（镰刀菌）、Candida（假丝酵母）等，常见的酚类污染物主要是苯酚、双酚A、壬基酚以及五氯酚。微生物通过加氧酶或脱氢酶，催化具有还原性的酚类污染物分解成CH4、CO2等无害终产物。如：苯酚首先经苯酚羟化酶降解为邻苯二酚，其后在邻苯二酚2,3—双加氧酶或1,2—双加氧酶作用下，经环裂解，形成三羧酸循环中间物。能够降解甲醛的微生物有Pseudomonas putida（恶臭假单胞菌）、P. Aeruginosa（铜绿假单胞菌）等。催化甲醛降解的关键酶是甲醛脱氢酶，其在谷胱甘肽以及NAD＋的辅助下，把进入细胞内的甲醛氧化为甲酸，其后甲酸在甲酸脱氢酶的作用下转化为CO2，由此实现对甲醛的去除。
微生物除臭剂对畜禽粪便的除臭分两种途径：类是以添加剂的形式加到饲料中，以增加饲料蛋白的消化吸收以及减少臭气排放；第二类是以控制畜禽排泄后粪便臭味为主要目的而采取的一些措施，在日本、美国等以有益微生物稀释液喷洒或给畜禽饮用的大型畜禽养殖场中，困扰了多年的恶臭逐渐消失了，苍蝇密度大大下降,畜禽变得温顺、安静，产蛋、产肉率明显增加。
3.2.3在生活垃圾处理中的应用
控制垃圾恶臭有两种途径：(1)在没有腐化的垃圾中加入有益菌与纤维素分解菌、木质素分解菌等组成微生物接种剂,进行堆肥,使之转化成肥料重新利用。(2)在已腐化有恶臭的垃圾中加入微生物菌群,控制恶臭。
据技术查新，国外生物除臭技术近年来发展较快，国内近年也有机构投入研究，但未见产品进入市场。本项目的研究不仅从理论基础上阐明了生物除臭的基本原理，而且分离筛选出了新的微生物除臭菌系，研制出了生物除臭剂的组合配方，解决了微生物除臭菌系的混合发酵的技术难题，完成了生物除臭剂的工业化实验，并通过200多次的不同环境、不同靶标的应用试验，近百次的配方改进，使该项目产品更趋于合理和成熟。
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微生物除臭剂我国《恶臭污染排放标准》（GB14554-93）对恶臭污染物的定义是：一切刺激嗅觉器官引起人们不如快及损害生活环境的气体物质。恶臭污染物能通过非生物途径以及生物途径产生。非生物途径主要指恶臭气体在炼焦、印刷、洗水、化肥农药合成等化工行业在其生产目的产品时由各化学反应直接产生，而生物途径则指恶臭气体由微生物分解畜牧养殖场、垃圾填埋场、肉类加工等场所废弃的有机物质的蛋白质而产生。纪树满等学者对常见恶臭污染物的分类有：①含硫化合物，如SO2、H2S等；②含氮化合物，如NH3、胺类、吲哚类等；③卤素及衍生物，如，卤代烃等；④脂肪烃及芳香烃类；⑤含氧化合物，如酚类、醛类等。目前常用的除臭方法包括物理法：物理吸附法、高能离子除臭法等；化学法：臭氧氧化法、活性氧氧化法、化学溶液吸收法、光催化氧化法等；生物法：生物滤池法、生物滴滤塔法、生物滤膜法、活性污泥法等。相对物理除臭，生物除臭具有臭气去除率高，运行费用低，设备运行检修成本低等优点。而相对化学除臭，生物除臭则在二次污染少，运行费用低、能耗低等方面占有优势。因此生物除臭具有广阔的应用前景。2微生物除臭剂2.1 含硫化合物恶臭气体的去除含硫化合物恶臭气体的去除对象主要是H2S。用于脱除H2S的微生物主要是好氧菌Beggiatoa（贝日阿托氏菌属）和Thiobacillus（硫杆菌属），以及光合细菌Chlorobium（绿菌属）和Chromatium（着色菌属）等。这些种类细菌通过硫化作用，能够把H2S氧化为S0或硫酸盐等物质，从而实现对H2S的去除。好氧菌能够氧化硫化氢形成硫酸盐，并从中获得能量。反应可表示如下：2H2S＋O2→2H2O＋2S＋能量2S＋3O2＋2H2O→2H2O4＋能量光合细菌为厌氧菌，其特点是在厌氧光照条件下，通过循环光合磷酸化不利用H2O，而利用H2S等无机物作为还原CO2的氢供体，从而实现H2S氧化为硫单质或进一步氧化成硫酸盐的化学转变。其反应可表示如下：2H2S＋CO2 ■ 2S＋H2O2S＋3CO2＋5H2O ■ 3（CH20）＋2H2SO42.2 含氮化合物恶臭气体的去除含氮化合物恶臭气体的去除对象主要是NH3。传统生物脱氮理论包括硝化作用和反硝化作用两个过程，即：①氨态氮首先在化能自养菌亚硝化细菌，如Nitrosobacteria（亚硝化单胞菌属）作用下氧化为亚硝酸；亚硝酸由化能自养生菌硝酸化细菌，如Nitrobacter（硝化杆菌属）作用下氧化为硝酸。硝化作用反应可表示如下：NH3＋O2＋2H＋＋2e- ■ NH2OH＋H2ONH2OH＋H2O ■ HNO2＋4H＋＋4e-②亚硝酸在厌氧反硝化细菌，如Bacillus Licheniformis（地衣芽孢杆菌）、Paracoccus denitrificans（脱氮副球菌）和若干Pseudomonas（假单胞菌属）作用下转化为气态氮化物N2和N2O。反硝化作用反应表示如下：NO2- ＋H2O ■ NO3- ＋2H＋＋2e-
